其一，污染源多且具有隐蔽性。我国农村区域的水体污染具有多方面的污染源，不仅包括各类企业，也包括生活污染和农业污染，污染源的复杂性就决定了其治理的复杂性。

　　其二，污染影响较大。农村水体污染影响突出，工业污染影响了农业生产和水产养殖，所有的污染都影响了人们的生活用水甚至饮用水的安全。在水污染的影响下，粮食、鱼类、肉类产品的安全性也都得不到保障，进一步危害人体健康。

　　其三，农村水体污染具有区域差异。我国地域广阔，各地水体、经济产业、人口等分布不同，因此各地农村水体污染的特点也有明显的差异。整体看来，农村水体污染程度在东南沿海地区较轻，在中部地区较重，在西部特别是山区则较为轻微。而一些地区如果某种产业过于集中，也会造成明显的水体污染差异。