1、政策法规不健全
我国关于污水治理的政策法规不健全是导致污水问题得不到控制的关键。国家虽明确规定了城市污水处理费标准，但在实际缴费过程中，大多数城市污水处理费征收工作步履维艰。城市污水排放和处理的监管体系还不健全，人们对再生水利用率较低，政府对此监管力度不够，直接影响城市污水处理政策执行。
2、污水处理技术落后
城市污水处理设施高效运转离不开先进的污水处理技术。一个时期以来,我国的污水处理技术在消化、吸收国外先进技术的同时不断创新。表面上看，城市污水处理技术有了进步,但实际上，随着工业化步伐的加快，现有的污水处理设施和污水处理技术很难满足国际标准，与国外的技术水平相比存在效率低、能耗高、自动化程度低等缺点, 相关处理技术设施仍有很大的空间等待探索。如脱磷除氮设施，污水污泥处置问题是一个亟待解决的问题。
3、投资力度不够
城市污水处理系统是城市的重要基础设施之一, 城市污水处理设施规模的不断扩大,污水处理能力年年攀高。污水处理设施建设任务繁重。资金是个根本问题。没有足够的资金，“提高污水处理能力”便只是一个口号。可见，资金短缺仍是制约污水处理工程建设的突出问题。 即使修建了城市污水处理厂,其高昂的运行维护管理费用也使一些城市污水处理厂处于闲置和半闲置状态。水污染没有得到控制，形成恶性循环。据统计:发达的美国、德国等国家用于污水处理方面的投资约占国民经济总产值的0.63%～0.98%。而我国仅占0.02%～0.03%。
4、管理水平低
城市污水处理系统技术较复杂,需要在有一定专业素质的操作人员的操作下发挥效用。目前，我国操作人员的技术素质及管理水平有待提高。这是造成污水厂不能发挥正常功效的决定因素。另外，目前我国污水处理的全部费用由政府全部“一肩挑”，常常出现运行经费不足的现象，政府缺少鼓励污水处理的经济政策,没有做到有价排放、有偿处理、有偿使用。
