1.河道水环境污染治理状况严重

随着工农业的发展，产业的转移，高耗水，高污染的企业向西部转移，向农村转移，相应的用水和污水排放相应的加大，农村河道污染治理面临着用水量和排污量加大的矛盾，各个利益部门又都是希望自己的利益最大化，很难站在全流域和长远的角度进行决策，流域上下游、左右岸之间的利益冲突将凸显，缺乏必要的利益协调机制。

2.河道被占用和堵塞严重，畅通工程任务艰巨

伴随着经济社会的快速发展和城市化进程的加快，河道水系被打散打乱，在发展交通道路，特别是经济开发区的开发过程中，缺乏对河道的有效保护，随意占用调蓄水面、填堵引排河道、侵占河湖水面事件时有发生；大量泥沙和有害物质的沉积加快了河道淤积和污染；以畅通河道为主的河网水系恢复工程任务艰巨，想要恢复到20世纪70年代的河网水系和水质状况需要付出几倍的物力、材力。

3.传统的河道治理，破坏了水环境生态系统，导致水灾加剧，生物多样性消失

传统的河道治理主要是考虑防洪和排涝，从水力学角度通过改善河道的水力性能，达到行洪排涝的目地，在局部范围内能对减轻水灾起到了一定的作用，但是忽视了洪水的不可消除性，反而使水灾向下游转移，使下游洪水频发，加剧了防汛薄弱地带的水灾问题，主要表现在两方面：一方面由于除险加固后的河道大都是裁弯改直，增加了河岸水力性能，使水流流速加快，水体动能增加，水流具有更强的破坏力，另一方面，防洪堤建造与河床的深挖严重破坏了河道的自然结构，使大面积河滩、河岸植被、洼地等消失，导致了河道内在滞洪功能消失，加剧了流域水灾的危害性和严重性。此外，传统的河道治理大部分采用的是浆砌块石和埋石砼，严重的破坏了河道的自然结构，使河岸的植被带被隔断，使水、土、植物、生物等之间形成的物质和能量循环系统被彻底破坏，不仅切断了地下水的补充通道，使地下水位不断下降：而且使生物生态环境破坏，许多生物无处安身，物种随之消失，自然河道形态弯曲，河床起伏，水流有缓有急，形成了丰富多样的生态环境组合，为生物的多样性提供适宜的生存环境，但是浆砌块石和砼的挡墙和护坡的建设，室息了土壤的呼吸，抑制了植物的生长和鱼类的生存，减弱了水体的自净能力，降低了河流的环境容量，加上社会的发展，人们的生活用水和污染物的增加，导致了河流水质恶化。

4.河道管理权限和责任不清，管理体制不明确

农村河道管理工作点多、面广，涉及行业较多，任务繁重，河道管理体制长期存在着“多龙管水，职责不清”的现象，造成河道的开发、利用、保护、管理各环节之间协调困难，目前农村河道长效管理工作只有大一点的河道由各级水行政主管部门管理，且水行政执法地位不高，权威尚未树立起来，在部分的农村河道都是由乡镇、村级等机构管理，管理体制不顺，个别地区作为主管部门的水利站管理职责被弱化，甚至已排除在河道管理主体之外，造成条线管理不顺，很难将一些管理要求贯彻下去，依法治水的难度较大，致使不少侵占河道、污染河水等违法行为无法得到及时严肃的查处，助长了涉水违法现象的滋生和蔓延。同时镇与镇，村与村之间的交界河道还不够明确，制约了长效管理工作有效开展。